El ingreso es en calidad de Parque Nacional. La zona de San Miguel está ubicada al noreste de Rocha y se creó en 1937, cuando se declaró Monumento Nacional al fuerte. Ocupa una superficie de 1.500 hectáreas.
En esta región del país predominan las llanuras bajas internas y lagunares, alternando con zonas más altas de sierras rocosas. La mayor parte del área está cubierta por monte indígena y una vegetación de pajonales. Los bañados del parque son importantes para la alimentación y estancia de numerosas especies.
Actualmente están en el SNAP el Paisaje Protegido Quebrada de los Cuervos en Treinta y Tres, el Parque Nacional de Esteros de Farrapos e Islas del Río Uruguay en Río Negro, el Parque Nacional Cabo Polonio en Rocha, el Paisaje Protegido Valle del Lunarejo en Rivera y el Paisaje Protegido Localidad Rupestre de Chamangá en Flores.