El caso está relacionado con fraudes fiscales por más de cuatro millones de euros.
Las denuncias refieren a desvíos de fondos que habría hecho Messi a través de "paraísos fiscales" entre los que se mencionó a Uruguay, provocando una respuesta del ministro de Economía Fernando Lorenzo.
La querella fue presentada el 12 de junio por el polo financiero de la Fiscalía contra Messi y su padre, Jorge Horacio Messi, ante el tribunal de Gava (cerca de Barcelona), donde reside el jugador, "por tres presuntos delitos contra la hacienda pública".
"La jueza ha admitido la querella al día de hoy (jueves) y les ha citado a declarar en septiembre", precisó a la AFP el portavoz de la Fiscalía, José Miguel Company.
"Ahora están imputados", agregó.
Messi deberá comparecer el 17 de septiembre a las 10 de la mañana (12H00 GMT) y su padre una hora después.
Según la acusación presentada el 12 de junio, Messi "obtuvo importantes ingresos" por derechos de imagen entre 2006 y 2009 que "debía tributar en sus declaraciones correspondientes" y no lo hizo.
La cantidad defraudada alcanzaría, según la fiscal, los 4,16 millones de euros: 1,06 millones en 2007, 1,57 millones en 2008 y 1,53 millones en 2009.
Según la fiscal, los Messi pretendieron "burlar" la tributación cediendo los derechos de imagen del delantero a "sociedades puramente instrumentales" ubicadas en paraísos fiscales como Belize y Uruguay.
El delantero del Barça y capitán de la selección albiceleste, de 25 años, había proclamado su inocencia inmediatamente después de enterarse de que él y su padre eran objeto de una investigación judicial.
La denuncia "nos causa sorpresa porque nunca hemos cometido infracción alguna", había asegurado en su página Facebook el cuatro veces ganador del Balón Oro de mejor jugador del mundo.
"Siempre hemos atendido todas nuestras obligaciones tributarias siguiendo los consejos de nuestros asesores fiscales, quienes se encargarán de aclarar esta situación", agregó.
Su club le había expresado toda su confianza.
El FC Barcelona no tiene "ninguna duda sobre la inocencia" de Messi, dijo el 13 de junio el presidente del club azulgrana, Sandro Rosell.
La prensa española apuntaba entonces que la imagen de "La Pulga" como estrella del fútbol de carácter humilde podía verse dañada.
El argentino se encuentra en la décima posición de la lista de Forbes de deportistas con mayores ingresos. La publicación le atribuye unos ingresos anuales de unos 41 millones de dólares anuales, repartidos prácticamente a partes iguales entre salario y derechos de imagen.
"Un símbolo bajo sospecha", tituló a mediados de junio el principal diario deportivo del país, Marca, argumentando en su editorial que el delantero azulgrana ha sembrado la duda sobre su imagen de deportista ejemplar.
